Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abcc4E9Q236 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abcc4E9Q236 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc4E9Q236 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc4E9Q236 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc4E9Q236 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc4E9Q236 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc4E9Q236 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc4E9Q236 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abcc4E9Q236 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abcc4E9Q236 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abcc4E9Q236 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc4E9Q236 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abcc4E9Q236 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc4E9Q236 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc4E9Q236 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc4E9Q236 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms