Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccdc171E9Q1U1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc171E9Q1U1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc171E9Q1U1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc171E9Q1U1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc171E9Q1U1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc171E9Q1U1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc171E9Q1U1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc171E9Q1U1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc171E9Q1U1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc171E9Q1U1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc171E9Q1U1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc171E9Q1U1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc171E9Q1U1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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