Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Myo5cE9Q1F5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Myo5cE9Q1F5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Myo5cE9Q1F5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Myo5cE9Q1F5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Myo5cE9Q1F5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Myo5cE9Q1F5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Myo5cE9Q1F5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Myo5cE9Q1F5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Myo5cE9Q1F5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Myo5cE9Q1F5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Myo5cE9Q1F5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Myo5cE9Q1F5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Myo5cE9Q1F5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Myo5cE9Q1F5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Myo5cE9Q1F5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Myo5cE9Q1F5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5cE9Q1F5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Myo5cE9Q1F5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Myo5cE9Q1F5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
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