Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B5

Fcgbp, Fc fragment of IgG-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FcgbpE9Q0B5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FcgbpE9Q0B5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FcgbpE9Q0B5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FcgbpE9Q0B5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FcgbpE9Q0B5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FcgbpE9Q0B5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FcgbpE9Q0B5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FcgbpE9Q0B5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FcgbpE9Q0B5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms