Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ddx60E9PZQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ddx60E9PZQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ddx60E9PZQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ddx60E9PZQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ddx60E9PZQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ddx60E9PZQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
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