Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21560D3Z7A4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21560D3Z7A4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21560D3Z7A4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms