Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6A3

Ism2, Isthmin 2, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism2D3Z6A3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ism2D3Z6A3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ism2D3Z6A3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ism2D3Z6A3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism2D3Z6A3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ism2D3Z6A3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms