Protein–RNA interactions for Protein: D3Z347

Slx, Sycp3-like X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlxD3Z347 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
SlxD3Z347 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SlxD3Z347 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
SlxD3Z347 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
SlxD3Z347 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
SlxD3Z347 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
SlxD3Z347 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
SlxD3Z347 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SlxD3Z347 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SlxD3Z347 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms