Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Rnf217D3YYI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,99
Rnf217D3YYI7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Rnf217D3YYI7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21,14■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Rnf217D3YYI7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rnf217D3YYI7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20,96■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Rnf217D3YYI7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,93■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rnf217D3YYI7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Rnf217D3YYI7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,2 ms