Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtl10D3YWW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl10D3YWW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtl10D3YWW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl10D3YWW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms