Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcb5B5X0E4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcb5B5X0E4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcb5B5X0E4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcb5B5X0E4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb5B5X0E4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcb5B5X0E4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms