Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp26c1B2RXA7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp26c1B2RXA7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp26c1B2RXA7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26c1B2RXA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp26c1B2RXA7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp26c1B2RXA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms