Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm5483B2RV77 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5483B2RV77 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm5483B2RV77 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5483B2RV77 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5483B2RV77 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5483B2RV77 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms