Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lonrf2B2RT44 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lonrf2B2RT44 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lonrf2B2RT44 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.6 ms