Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms