Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed5B2RPU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed5B2RPU8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed5B2RPU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed5B2RPU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed5B2RPU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms