Protein–RNA interactions for Protein: A6X8I0

Gm1993, Predicted gene 1993, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1993A6X8I0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm1993A6X8I0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm1993A6X8I0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm1993A6X8I0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm1993A6X8I0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm1993A6X8I0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm1993A6X8I0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm1993A6X8I0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm1993A6X8I0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm1993A6X8I0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms