Protein–RNA interactions for Protein: A3KGS3

Ralgapa2, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ralgapa2A3KGS3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ralgapa2A3KGS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ralgapa2A3KGS3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ralgapa2A3KGS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Ralgapa2A3KGS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ralgapa2A3KGS3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ralgapa2A3KGS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ralgapa2A3KGS3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25,64■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ralgapa2A3KGS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,58■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ralgapa2A3KGS3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ralgapa2A3KGS3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ralgapa2A3KGS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Ralgapa2A3KGS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Ralgapa2A3KGS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ralgapa2A3KGS3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ralgapa2A3KGS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ralgapa2A3KGS3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,9 ms