Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6880A3KG45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6880A3KG45 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6880A3KG45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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