Protein–RNA interactions for Protein: A2RRY9

4930595M18Rik, RIKEN cDNA 4930595M18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595M18RikA2RRY9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930595M18RikA2RRY9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930595M18RikA2RRY9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930595M18RikA2RRY9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930595M18RikA2RRY9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930595M18RikA2RRY9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms