Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cavin4A2AMM0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cavin4A2AMM0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cavin4A2AMM0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cavin4A2AMM0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Cavin4A2AMM0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Cavin4A2AMM0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Cavin4A2AMM0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Cavin4A2AMM0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cavin4A2AMM0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Cavin4A2AMM0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Cavin4A2AMM0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cavin4A2AMM0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cavin4A2AMM0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cavin4A2AMM0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cavin4A2AMM0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cavin4A2AMM0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Cavin4A2AMM0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Cavin4A2AMM0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30,51■■■□□ 2,48
Cavin4A2AMM0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Cavin4A2AMM0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Cavin4A2AMM0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms