Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zkscan16A2ALW2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zkscan16A2ALW2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zkscan16A2ALW2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zkscan16A2ALW2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zkscan16A2ALW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms