Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39aA2ACP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39aA2ACP1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc39aA2ACP1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms