Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shisal2aA2A9G7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal2aA2A9G7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms