Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Akap17bA2A3V1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Akap17bA2A3V1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Akap17bA2A3V1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Akap17bA2A3V1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Akap17bA2A3V1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Akap17bA2A3V1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms