Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1bA1Z198 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1bA1Z198 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrp1bA1Z198 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1bA1Z198 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.4 ms