Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YD17

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YD17 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A286YD17 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A286YD17 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A286YD17 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A286YD17 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A286YD17 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A286YD17 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A286YD17 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A286YD17 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A286YD17 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YD17 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YD17 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A286YD17 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A286YD17 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.5 ms