Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0U1RNP2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0U1RNP2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RNP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RNP2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RNP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RNP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms