Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup205A0A0J9YUD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup205A0A0J9YUD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup205A0A0J9YUD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup205A0A0J9YUD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup205A0A0J9YUD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup205A0A0J9YUD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup205A0A0J9YUD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup205A0A0J9YUD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup205A0A0J9YUD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup205A0A0J9YUD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.1 ms