Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms