Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28576A0A087WRP6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28576A0A087WRP6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28576A0A087WRP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm28576A0A087WRP6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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