Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms