Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms