Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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SAMD8Q96LT4 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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SAMD8Q96LT4 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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SAMD8Q96LT4 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SAMD8Q96LT4 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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