Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms