Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms