Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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HERC1Q15751 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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HERC1Q15751 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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HERC1Q15751 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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HERC1Q15751 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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