Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms