Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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