Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms