Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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