Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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