Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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