Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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