Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms