Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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UBXN4Q92575 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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UBXN4Q92575 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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