Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCBE1Q6UXH8 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms