Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TAF1L-201ENST00000242310 6216 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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