Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTF1Q16619 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms