Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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GRIK4Q16099 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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GRIK4Q16099 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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GRIK4Q16099 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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